Опубликовано : Окт 26, 2019

Модель предсказывает виды летучих мышей с возможностью распространения смертельного вируса Нипах в Индии

Модель предсказывает виды летучих мышей с возможностью распространения смертельного вируса Нипах в Индии
                Индийская летучая лисица ночевала возле бананов. Предоставлено: Раджиб Ислам.

С момента своего обнаружения в 1999 году вирус Нипах почти ежегодно регистрировался в Юго-Восточной Азии, причем наибольшее поражение нанесли Бангладеш и Индия. В новом исследовании, опубликованном сегодня в Заболеваниях тропических животных, которым не уделяется должное внимание, ученые использовали машинное обучение для выявления видов летучих мышей, которые могут содержать вирус Нипах, с упором на Индию — место вспышки 2018 года. Четыре новых вида летучих мышей были отмечены как приоритеты наблюдения.
                                                                                       

Барбара Хан, эколог по болезням в Институте экосистемных исследований Кэри, является соавтором статьи. Она объясняет: «Несмотря на растущее понимание того, что летучие мыши играют роль в передаче вируса Нипах в Юго-Восточной Азии, меньше известно о том, какие виды представляют наибольшую опасность. Наша цель состояла в том, чтобы помочь выявить дополнительные виды с высокой вероятностью переноса». Нипах, чтобы нацелить эпиднадзор и защитить здоровье населения. «

Райна К. Плорайт, эколог по болезням в Университете штата Монтана, также была одним из ведущих авторов. Она отмечает: «Поскольку эта статья собиралась напечатать, еще один случай вируса Нипа был подтвержден в Керале. Сообщество общественного здравоохранения снова было переведено в реактивный режим. Наше исследование является отправной точкой для исследования, которое должно содержать Нипу в его источнике. поэтому мы управляем риском распространения, а не человеческими страданиями. «

Вирус Нипах — это очень смертоносный, появляющийся генипавирус, который может передаваться людям из жидкостей организма зараженных летучих мышей. Еда фруктов или питье сока финиковой пальмы, который был загрязнен летучими мышами, был отмечен как путь передачи. После заражения люди могут распространять вирус непосредственно среди других людей, что вызывает вспышку. Домашние свиньи также являются связующими звеньями, которые могут заразить людей. Там нет вакцины и вирус имеет высокий уровень смертности.

«Вирусы, переносимые летучими мышами, встречаются во всем мире, однако усилия по наблюдению и отбору проб были неоднозначными», — говорит Хан. «Вероятно, есть много компетентных хостов Nipah, которые не были идентифицированы. По этой причине существует необходимость в разработке новых методов, учитывающих все имеющиеся данные, для руководства процессом отбора проб в Индии и в других регионах».

В Индии обитает около 113 видов летучих мышей. Только 31 из этих видов были отобраны для вируса Нипах, и у 11 было обнаружено, что антитела имеют сигнал о потенциальном хозяине. Плорайт отмечает: «Учитывая роль, которую летучие мыши играют в передаче вирусов, заразных людям, инвестиции в понимание этих животных были низкими. Последнее комплексное и систематическое таксономическое исследование летучих мышей в Индии было проведено более века назад».

Машинный наклон, форма искусственного интеллекта, использовался для обозначения видов летучих мышей, способных укрывать Нипу. Хан объясняет: «Рассматривая признаки видов летучих мышей, которые, как известно, несут Нипу во всем мире, наша модель смогла сделать прогнозы о дополнительных видах летучих мышей, проживающих в Индии, которые могут нести вирус и передавать его людям. Эти летучие мыши в настоящее время не являются на радаре общественного здравоохранения и заслуживают дополнительного изучения. «

Во-первых, команда собрала опубликованные данные о видах летучих мышей, которые, как известно, несут нипах и других хенипавирусов во всем мире. Данные включали 48 признаков 523 видов летучих мышей, включая информацию о методах поиска пищи, рационе питания, миграционном поведении, географическом ареале и воспроизводстве. Они также рассмотрели условия окружающей среды, в которых произошли вторичные выбросы.

Затем они применили подход машинного обучения, основанный на особенностях, к подмножеству видов, встречающихся в Азии, Австралии и океане. Их алгоритм идентифицировал известные Nipah-позитивные виды летучих мышей с точностью до 83%. Он также идентифицировал шесть видов летучих мышей, которые встречаются в Азии, Австралии и Океане, которые имеют признаки, которые могут сделать их компетентными хозяевами и должны быть приоритетными для наблюдения. Четыре из этих видов встречаются в Индии, два из которых встречаются в Керале.

Плоурайт объясняет: «Мы намереваемся делать основанные на характеристиках прогнозы вероятных резервуаров генипавируса вблизи Кералы. Мы сфокусировались на узкой области, но модель оказалась успешной в выявлении хозяев Nipah, продемонстрировав, что этот метод может служить мощным инструментом для руководства надзор за Nipah и другими системами болезней. «

Авторы отмечают, что их прогнозы должны сочетаться с местными знаниями об экологии летучих мышей, включая распределение, численность и близость к людям, для разработки планов отбора проб, которые могут эффективно определять хозяев летучих мышей, представляющих опасность для людей. В этой работе приведен список видов для раннего наблюдения, и его не следует рассматривать как окончательный список водоемов.

«Обследование популяций летучих мышей высокого риска может обеспечить раннее предупреждение ветеринаров и органов общественного здравоохранения о необходимости принятия профилактических мер, необходимых для предотвращения вспышки. Выявление того, какие виды переносят болезни, является важным первым шагом в планировании эпиднадзора. Нам также необходимо установить приоритетность исследований какие штаммы вируса представляют наибольший риск для людей. В конечном счете, цель состоит в том, чтобы погасить риск, а не бороться с пожарами «, — заключает Хан.

Spread the love

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *