Опубликовано : Окт 26, 2019

РНК-секвенирование, используемое для обнаружения новых генов и путей при целиакии

целиакия
                Кредит: CC0 Public Domain

Исследователи из Центра исследований иммунологии и биологии слизистой оболочки при Массачусетской детской больнице (MGHfC) обнаружили новые гены и пути, связанные с ранними стадиями развития целиакии и продолжающимся воспалением и сопутствующими заболеваниями, связанными с этим состоянием. Результаты, опубликованные в PLOS One, включают анализ последовательностей РНК при биопсии двенадцатиперстной кишки от людей с целиакией и без нее и согласуются со многими ранее описанными путями развития целиакии.
                                                                                       

В сотрудничестве с Regeneron Pharmaceuticals, Inc. — биофармацевтической компанией, базирующейся в Тарритауне, Нью-Йорк, — исследователи провели секвенирование всего транскриптомного ружья 12 пациентов с активной целиакией, 15 пациентов с целиакией в стадии ремиссии без повреждения кишечника и 15 человек. без целиакии. Анализируя транскриптом участника — общую сумму транскрибированных последовательностей РНК — исследователи обнаружили, какие гены были экспрессированы, а какие не экспрессированы, чтобы определить генетические признаки, связанные с целиакией.

«Мы знаем, что целиакия является многофакторной болезнью, с этим аутоиммунным состоянием связано около 57 генов. Выполняя РНК-секвенирование, мы обнаружили дополнительные генетические» сигнатуры «и приблизились к определению целей для будущих терапевтических агентов — при целиакии и, возможно, другие аутоиммунные заболевания «, — говорит Морин Леонард, доктор медицинских наук, клинический директор Центра исследований и лечения целиакии при MGHfC, преподаватель педиатрии в Гарвардской медицинской школе и первый автор исследования.

Результаты показали четкие различия в экспрессии генов между тремя группами. Исследователи обнаружили значительные различия в экспрессии 945 генов между людьми с активной целиакией и не целиакией; 290 генов между людьми с целиакией в стадии ремиссии и не целиакией; и 538 генов между активной глютеновой группой и целиакией в группе ремиссии.

«Выявленные гены активировали три основных пути: врожденный иммунитет, проницаемость кишечника и дифференцировку в созревании клеток», — говорит Алессио Фазано, доктор медицинских наук, директор Центра исследований и лечения целиакии в MGHfC, профессор педиатрии в Гарвардской медицинской школе и старший автор отчета PLOS One. «Мы можем подтвердить, что эти функции играют важную роль при развитии целиакии». Он отмечает, что экспрессия некоторых генов нормализуется, когда пациенты садятся на безглютеновую диету, а некоторые нет. Фазано отмечает, что это открытие может дать некоторое представление о том, почему у некоторых людей стойкое повреждение кишечника даже после строгой безглютеновой диеты.

Из огромного массива полученных данных исследователи решили сосредоточиться на функциональных путях, которые значительно отличались между активной чревной группой и теми, кто находился в стадии ремиссии. Два из трех главных нарушенных путей в активной целиакии включали передачу сигналов цитокинами и хемокинами, которые известны как «первые респондеры» иммунной системы и маркеры воспаления врожденного иммунитета на ранних стадиях развития заболевания. Исследователи также нашли доказательства, позволяющие предположить, что риск сопутствующего аутоиммунного расстройства может быть высоким при активной целиакии, так как пути развития диабета 1 типа, волчанки и аутоиммунного заболевания щитовидной железы также были повышены.

Определение потенциальных целей для терапевтического вмешательства при целиакии и других аутоиммунных заболеваниях является долгосрочной целью исследовательской группы. «Это исследование — только начало. Наши результаты обеспечивают основу для будущих валидационных исследований для изучения ранних этапов патогенеза целиакии и изучения состояния ремиссии», — говорит Леонард. В других центрах ведутся исследования по использованию транскриптома в таргетной терапии при воспалительных заболеваниях кишечника, и Леонард и Фазано надеются увидеть, что это будет воспроизведено при целиакии.

Spread the love

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *