Опубликовано : Авг 24, 2020

Метод объединения COVID-19 выявляет бессимптомных носителей

covid test
Кредит: Unsplash/CC0 Public Domain

Новое рецензируемое исследование, опубликованное в Science Advances, подтверждает успех нового объединенного теста на COVID-19, который выявляет всех положительных субъектов, включая бессимптомных носителей, в одном раунде тестирования.

P-BEST, алгоритмический метод для эффективного тестирования SARS-CoV-2 на основе объединения, был разработан группой исследователей из Университета Бен-Гуриона в Негеве (BGU), Национального института биотехнологии в Негеве ( NIBN), Открытый университет Израиля (OUI) и Медицинский центр Университета Сорока.

«Примерно от 10 до 30% пациентов, инфицированных COVID-19, не имеют симптомов, и значительное распространение вируса может произойти за несколько дней до появления симптомов», — говорит профессор Анхель Поргадор, заместитель вице-президента BGU по исследованиям и разработкам и член NIBN. «Пока не будет вакцина, будет срочно необходимо расширить возможности диагностического тестирования, чтобы можно было проводить скрининг бессимптомных и предсимптоматических групп населения. Этот новый одноэтапный диагностический тест поможет предотвратить распространение болезни за счет более ранней идентификации этих пациентов и по более низкой цене за счет значительно меньшего количества тестов «

В текущем исследовании 384 образца были разделены всего на 48 пулов, что обеспечило восьмикратное повышение эффективности тестирования и аналогичное снижение затрат на тестирование реагентов. Каждый пул включает уникальный набор из 48 образцов, где каждый образец появляется ровно в шести пулах с использованием определенного комбинаторного дизайна. Затем эти 48 пулов были протестированы в вирусологической лаборатории Сорока с использованием диагностического протокола на основе ПЦР на COVID-19, который включал этап экстракции РНК. После тестирования каждого из 48 пулов индивидуально исследователи успешно идентифицировали до пяти положительных носителей в 384 образцах, без необходимости тестирования субъектов в этом пуле.

«P-BEST можно настроить на основе скорости передачи данных», — говорит д-р Ноам Шентал, глава отдела компьютерных наук OUI. «Чем ниже скорость передачи, тем выше эффективность. Наш метод объединения был протестирован с использованием усовершенствованной роботизированной системы для работы с жидкостями, которая может выполнить задачу за час и может быть выполнена в типичной клинической диагностической лаборатории в любой точке мира».

Исследователи также проверили эффективность P-BEST в клиническом исследовании, направленном на выявление бессимптомных и умеренно симптоматических медицинских работников. В ходе исследования они обследовали 1115 бессимптомных медицинских работников Сорока с помощью P-BEST. В набор испытуемых входил весь штат Сорока, включая врачей, медсестер, помощников медсестер, а также клинический и административный персонал.

В общей сложности 296 (26,5%) субъектов работали в прямом контакте с пациентами с COVID-19. В когорте 926 (93,1%) субъектов заявили, что у них нет симптомов, 71 (6,3%) сообщили о легком кашле, а 70 (6,3%) сообщили о ринорее. 1115 участников были протестированы с использованием всего 144 тестов. Все протестированные пулы были отрицательными. Из-за снижения количества носителей в Израиле в апреле 2020 года в третью партию вслепую добавили образец от пациента с COVID-19, который был идентифицирован положительно.

«P-BEST идеально подходит для проведения скрининга носителей при очень низком уровне инфицирования, менее одного процента», — говорит профессор Томер Герц из отдела микробиологии, иммунологии и генетики BGU Shraga Segal. «Это обеспечит значительную экономию реагентов и других ресурсов для диагностического тестирования при значительном увеличении возможностей тестирования».

BGU и OUI создали компанию Poold Diagnostics для проведения крупномасштабного тестирования на COVID-19 после клинического исследования. В середине августа Министерство здравоохранения Израиля одобрило использование P-BEST в клинических лабораториях государства Израиль.

«Исследовательская группа BGU утвердила метод объединения, который позволит проводить точное и недорогое тестирование на COVID-19 значительного населения в Израиле и, в конечном итоге, в других странах», — говорит Дуг Сесерман, главный исполнительный директор города Нью-Йорка. на базе ААБГУ. «BGU COVID-19 Response Effort продвигается вперед по коммерциализации ряда технологий и инноваций для смягчения последствий этой пандемии»./P>

Spread the love

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *