Опубликовано : Сен 07, 2020

Нигерийские ученые выделили семь линий передачи SARS-CoV-2: почему это важно

Нигерийские ученые определили семь линий происхождения SARS-CoV-2: почему это важно
Нигерийские ученые работают над тем, чтобы лучше понять коронавирус. Фото: Африканский центр передового опыта в области геномики инфекционных заболеваний.

К первой неделе августа 2020 года пандемия COVID-19 унесла жизни около 654 000 человек во всем мире. В Нигерии по состоянию на 28 июля было зарегистрировано 38 945 подтвержденных случаев заболевания с 813 смертельными исходами.

Последней пандемия поразила африканский континент, и в большинстве стран ее показатели остаются сравнительно низкими. Но среди ученых есть твердое мнение, что данные, полученные на континенте, недооцениваются, поскольку страны борются с испытаниями.

По мере того, как продолжается лихорадочная работа по поиску вакцины, такие страны, как Нигерия, продолжают делать все возможное, чтобы обуздать распространение вируса.

В Нигерии это включает поддержку как государственного, так и частного секторов и научных кругов. Одним из примеров проделанной работы является тестирование и исследование, проводимое Африканским центром передового опыта в области геномики инфекционных заболеваний, Университет Редимера, Эде, штат Осун. Центр занимается исследованиями инфекционных заболеваний, включая малярию, лихорадку Ласса, лихорадку Эбола, ВИЧ, желтую лихорадку и, в последнее время, SARS-CoV-2.

Нигерия зарегистрировала свою первую коронавирусную инфекцию 27 февраля 2020 года от итальянского иммигранта, образцы которого были отправлены в Африканский центр передового опыта в области геномики инфекционных заболеваний Нигерийским центром по контролю заболеваний для секвенирования генома. В результате этой работы 6 марта 2020 г. были опубликованы первые данные о последовательности SARS-CoV-2 на африканском континенте.

Секвенирование генома помогает нам понять вирус, его эпидемиологию и эволюцию. Во всем мире существует только один штамм SARS-CoV-2, который также совпадает со штаммом, циркулирующим в Нигерии. Однако в мире циркулирует более 1000 линий этого нового вируса.

Классификация по происхождению основана на мутациях или генетических вариантах, которые связывают наследственный тип с генетикой потомков, которые не меняют физиологию вируса.

В основном вирусные клоны образуются, когда возникающие мутации не изменяют кодируемый вирусный белок. Однако любая мутация, которая приводит к изменению вирусной патогенности, вирулентности или иммуногенности, станет новым штаммом.

Если мутация затрагивает часть вируса, которую иммунная система использует для нейтрализации вируса, тогда это становится штаммом, который может заразить людей, ранее инфицированных или вакцинированных. Пример этого происходит с вирусом гриппа, поэтому каждый год требуется новая вакцина от сезонного гриппа.

На данный момент мы идентифицировали семь из этих более 1000 родословных в Нигерии. Каждая линия представляет собой последовательности из разных стран.

Происхождение

У некоторых родословных источники происхождения совпадают.

Первая линия представляет собой вирусные последовательности из Китая и других стран, экспортируемых из Юго-Восточной Азии, Японии, Южной Кореи, Австралии, США и Европы.

Вторая линия представляет собой вирусную последовательность из итальянской вспышки. Третий представляет новую европейскую родословную. Четвертый представляет собой эпизоды из Великобритании, Исландии и Турции.

Пятый представляет собой последовательности из Нидерландов, Турции, Саудовской Аравии, Египта, Финляндии и Англии. Шестой представляет последовательность из Нидерландов. Седьмой представляет последовательности из Турции, Саудовской Аравии, Египта, Финляндии и Англии.

Линии, идентифицированные в Нигерии, не отличаются от линий, идентифицированных в других частях мира, и пока нет сообщений о штаммах или линиях, уникальных для Нигерии.

Количество линий передачи, циркулирующих в Нигерии, будет обновляться по мере того, как мы будем генерировать больше данных о последовательностях, принимая во внимание текущие доказательства передачи от сообщества.

Важно отслеживать родословную, поскольку они могут быть очень полезны для определения того, как вирус распространяется через сообщества или популяции. Это означает, что если появится новый штамм, у ученых будет важная информация, необходимая для его сдерживания. Это особенно важно для африканского региона, потому что, если новый штамм окажется более вирулентным или более передаваемым, это окажет серьезное давление на слабые системы здравоохранения.

Что может означать мутация SARS-CoV-2

Мутация SARS-CoV-2 может дать вирусу преимущество. Например, вирус с выгодной мутацией может легче поражать людей, тем самым более легко распространяясь между людьми; он может быть менее распознаваемым иммунной системой или более патогенным.

Недавние сообщения свидетельствуют о том, что новые «штаммы» SARS-CoV-2 возникли в результате мутации, которая может усилить тяжесть пандемии.

В ходе исследования был проанализирован набор мутаций в шиповом белке SARS-CoV-2 и сделан вывод о том, что частота конкретной мутации увеличивалась по мере распространения вируса из Китая в Европу, Северную Америку и Австралию. Авторы пришли к выводу, что это увеличение частоты произошло потому, что мутация сделала вирус более трансмиссивным.

Ученые в Нигерии, как и повсюду, очень внимательно следят за этим развитием. В Нигерии наблюдается тенденция к увеличению числа мутаций этого спайкового белка.

Почему это важно

Постоянный мониторинг вирусных генетических изменений или мутаций важен, поскольку он дает ценную информацию об эволюции вируса и его последствиях.

Если мутация произойдет в области вируса, который использовался для разработки вакцины, вакцина не будет столь эффективной. Вот что происходит с вакцинами от гриппа, потому что вирус продолжает мутировать в новый штамм.

Мы пока мало что знаем о SARS-CoV-2. И мы не знаем, мутирует ли вирус в новый штамм. Если это произойдет, может потребоваться разработка новой вакцины.

Ничего нельзя сделать для предотвращения мутации вирусов. Они делают это естественно в качестве стратегии выживания. Эти мутации происходят, когда вирус совершает ошибку при репликации его ДНК или РНК, или из-за давления отбора.

В настоящее время исследователи работают над определением количества циркулирующих с медицинской точки зрения штаммов SARS-Cov-2 и каковы его последствия для лечения и разработки вакцины./p>

Spread the love

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *