Опубликовано : Окт 03, 2020

Новый тест на COVID не использует дефицитные реагенты, выявляет все, кроме наименее заразных

Новый тест на COVID не использует дефицитные реагенты, выявляет все, кроме наименее заразных
Джейсон Боттен и Эмили Брюс, которые первыми разработали усовершенствованный тест на COVID-19, в котором не используются дефицитные химические вещества, в своей исследовательской лаборатории Медицинского колледжа Ларнера при Университете Вермонта. Устройство между ними используется для измерения наличия и количества вирусной РНК в образцах пациентов. Предоставлено: Брайан Дженкинс.

Основным препятствием на пути крупномасштабного тестирования на коронавирусную инфекцию в развивающихся странах является нехватка ключевых химикатов или реагентов, необходимых для теста, в частности тех, которые используются для извлечения генетического материала вируса или РНК.

Группа ученых из Университета Вермонта, работающая в партнерстве с группой из Вашингтонского университета, разработала метод тестирования вируса COVID-19, который не использует эти химические вещества, но все же дает точный результат, открывающий путь к недорогому и широко доступному тестированию как в развивающихся странах, так и в промышленно развитых странах, таких как США, где запасы реагентов снова недостаточны.

Метод теста, опубликованный 2 октября в PLOS Biology, не включает этап широко используемого теста полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР), где требуются ограниченные реагенты.

/p>

Точность 92%, не учитываются только самые низкие вирусные нагрузки

Точность нового теста была оценена группой исследователей из Вашингтонского университета под руководством Кейта Джерома, директора университетской лаборатории молекулярной вирусологии, с использованием 215 образцов COVID-19, которые показали положительные результаты ОТ-ПЦР. с диапазоном вирусных нагрузок и 30 — отрицательными.

Он правильно определил 92% положительных образцов и 100% отрицательных.

Положительные образцы, которые новый тест не обнаружил, имели очень низкий уровень вируса. Эксперты в области общественного здравоохранения все чаще полагают, что сверхчувствительные тесты, выявляющие людей даже с минимальной вирусной нагрузкой, не нужны для замедления распространения болезни.

«Это был очень положительный результат», — сказал Джейсон Боттен, эксперт по патогенным РНК-вирусам Медицинского колледжа Ларнера Университета Вермонта и старший автор статьи PLOS Biology. Коллега Боттена Эмили А. Брюс — первый автор статьи.

«Вы можете пройти идеальный тест, или вы можете использовать тот, который соберет подавляющее большинство людей и остановит передачу», — сказал Боттен. «Если сейчас игра сосредоточена на поиске заразных людей, нет причин, по которым этот тест не должен быть в центре внимания, особенно в развивающихся странах, где программы тестирования часто ограничены из-за нехватки реагентов и других материалов».

Пропуск шага

Стандартный тест ПЦР состоит из трех этапов, в то время как эта более простая версия стандартного теста состоит только из двух, сказал Боттен.

«На этапе 1 теста RT-PCR вы берете тампон с образцом из носа, зажимаете конец и помещаете его в сосуд с жидкостью или средой. Любой вирус на тампоне переместится из тампона в средний «, — сказал он. «На шаге 2 вы берете небольшой образец вирусосодержащей среды и используете химические реагенты, которые часто отсутствуют, для извлечения вирусной РНК. На шаге 3 вы используете другие химические вещества для значительного усиления любых генетических вирусов. материал, который может быть там. Если вирус присутствовал, вы получите положительный сигнал «

В новом тесте второй шаг пропускается.

«Здесь берется образец среды, в которой находился мазок из носа, и он переходит непосредственно к третьему этапу амплификации», — сказал Боттен, устраняя необходимость в дефицитных реагентах для экстракции РНК, а также значительно сокращая время, трудозатраты и затраты. для извлечения вирусной РНК из среды на шаге 2.

Боттен сказал, что этот тест идеально подходит для программ скрининга как в развитых, так и в развивающихся странах, поскольку он недорогой, требует гораздо меньше времени на обработку и надежно определяет тех, кто может распространить болезнь.

Его низкая стоимость и эффективность могут расширить возможности тестирования для групп, которые в настоящее время не тестируются, сказал Боттен, включая бессимптомных жителей дома престарелых, основных рабочих и школьников. Стандартный тест RT-PCR может быть зарезервирован для групп, таких как медицинские работники, где важна точность, близкая к 100%.

Влиятельная подготовка к печати указывает путь к широкому распространению тестирования

Двухэтапный тест, разработанный командой Университета Вермонта, впервые привлек внимание научного сообщества в марте, когда предварительные результаты, которые точно идентифицировали шесть положительных и три отрицательных образца Вермонта, были опубликованы в виде препринта в bioRxiv, открытом доступе. хранилище биологических наук. Препринт был загружен 18 000 раз — за первую неделю он занял 17-е место среди 15 миллионов статей, опубликованных на сайте, — а реферат был просмотрен 40 000 раз.

Боттен получил известия от лабораторий по всему миру, которые видели препринт и хотели узнать больше о новом тесте.

«Они сказали:» Я из Нигерии или Вест-Индии. Мы не можем проводить испытания, и на карту поставлены жизни людей. Вы можете нам помочь? «

Боттен также получил известие от Сирил Петтит, директора HESI, Института наук о здоровье и окружающей среде, некоммерческой организации, которая мобилизует научный опыт и методы для решения ряда глобальных проблем здравоохранения, которая также ознакомилась с препринтом.

Петтит попросила Боттен присоединиться к аналитическому центру ученых-единомышленников, который она организовывала, целью которого было повышение глобального потенциала тестирования на COVID-19. Центральным элементом будет тест, разработанный командами Университета Вермонта и Университета Вашингтона. Чтобы стимулировать глобальный отклик, группа опубликовала призыв к действию в EMBO Molecular Medicine.

И он принял меры, связавшись с 10 лабораториями в семи странах, включая Бразилию, Чили, Малави, Нигерию и Тринидад/Тобаго, а также США и Францию, чтобы узнать, будут ли они заинтересованы в предоставлении двух- пошаговое испытание пробный запуск. «В целом ответ был положительным», — сказал Петтит.

Информационно-просветительская деятельность привела к появлению новой программы HESI под названием PROPAGATE. Каждая из лабораторий сети PROPAGATE будет использовать двухэтапный тест на серии положительных и отрицательных образцов, присланных им Вашингтонским университетом, чтобы проверить, могут ли они повторить результаты, достигнутые университетом.

Исследование уже показало многообещающие результаты. Одна из лабораторий в Чили также использовала тест на собственных образцах, полученных от сообщества, и получила точные результаты.

Если все пойдет хорошо, Петтит и ее коллеги из Университета Вермонта и Университета Вашингтона, а также ученые из 10 партнерских сайтов планируют опубликовать результаты.

«Цель состоит в том, чтобы сделать двухэтапный тест доступным для любой лаборатории в мире, сталкивающейся с такими препятствиями, и увидеть широкое распространение», — сказала она./p>

Spread the love

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *