Опубликовано : Окт 08, 2020

Ранние случаи COVID-19 в Южной Калифорнии связаны с Нью-Йорком

SARS-CoV-2, COVID-19
Раскрашенная сканирующая электронная микрофотография клетки (синий), сильно инфицированной частицами вируса SARS-CoV-2 (красный), выделенной из образца пациента. Снимок сделан в Комплексном исследовательском центре NIAID (IRF) в Форт-Детрике, штат Мэриленд. Кредит: NIAID

Большинство пациентов с COVID-19 (коронавирус) в Южной Калифорнии в первые месяцы пандемии, по-видимому, были инфицированы разновидностью вируса SARS-CoV-2, завезенной в регион из штата Нью-Йорк через Европу, а не напрямую. из Китая, где вирус был впервые обнаружен, согласно новому исследованию, проведенному в Cedars-Sinai.

Выводы были основаны на генетическом анализе вируса, обнаруженного в образцах тканей 192 пациентов с диагнозом COVID-19 в Сидарс-Синай.

Исследователи заявили, что, по их мнению, их исследование было первой опубликованной генетической характеристикой SARS-CoV-2 в популяции Лос-Анджелеса с использованием передового метода, известного как секвенирование следующего поколения, которое анализирует все гены или геном вируса или вируса. другой организм. Исследование было опубликовано 7 октября в журнале JAMA Network Open.

«На основании этих выводов мы пришли к выводу, что SARS-CoV-2, вероятно, был занесен в сообщество Лос-Анджелес преимущественно из штата Нью-Йорк, но также через несколько других независимых маршрутов передачи, которые включали штат Вашингтон и Китай», — сказал Эрик Вейл, доктор медицинских наук. , доцент и директор отделения молекулярной патологии отделения патологии и лабораторной медицины Cedars-Sinai. Он был соавтором исследования.

В частности, исследователи обнаружили, что около 15% образцов вируса, взятых у пациентов с COVID-19 в Сидарс-Синай в период с 22 марта по 15 апреля, были генетически подобны опубликованным профилям вирусов SARS-CoV-2 из Азии, а 82 % имеет близкое сходство с вариантами, происходящими из Европы.

«Для нас было удивительно, что Нью-Йорк оказался источником столь значительной части вируса Лос-Анджелеса, тем более что первый подтвержденный случай COVID-19 в США касался человека, который вернулся в штат Вашингтон после посещения Китая. «- сказала Жасмин Пламмер, доктор философии, научный сотрудник Центра биоинформатики и функциональной геномики Сидарс-Синай и заместитель директора Applied Genomics, Computing & Translational Core. Она была другим соавтором исследования.

Кроме того, анализ вируса SARS-CoV-2 с использованием секвенирования следующего поколения оказался настолько точным, что исследователи смогли идентифицировать уникальный кластер из 13 пациентов с коронавирусом, все члены одной религиозной конфессии, живущие в 2,4 мили радиуса друг от друга. Это открытие указывает на возможность использования этого метода для мониторинга распространения болезни среди местного населения.

«Это новаторское исследование предоставляет данные для проведения сравнительного генетического анализа идентифицирующих особенностей, уникальных для SARS-CoV-2», — сказал Дэвид Фришберг, доктор медицинских наук, заведующий кафедрой академической патологии и профессор патологии и лабораторной медицины в Cedars-Sinai. «Открытия секвенирования предоставляют важную информацию о COVID-19, его происхождении и эволюции, и они могут даже помочь предсказать его будущую траекторию»./P>

Spread the love

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *